براساس ارزشیابی وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی دانشگاه علوم پزشکی تهران با دارا بودن 32 مرکز تحقیقاتی، هشت قطب علمی و دو مرکز رشد ( مرکز رشد علوم دارویی و مرکز رشد تجهیزات پزشکی ) رتبه نخست پژوهشی را در سه سال پیاپی کسب کرده است .

به گزارش سرویس «پژوهشی» خبرگزاری دانشجویان ایران (ایسنا) واحد علوم پزشکی تهران، این دانشگاه با دارا بودن هشت قطب علمی شامل قطب علمی تحقیقات غدد و متابولیسم، قطب علمی تحقیقات هماتولوژی، آنکولوژی و پیوند مغز استخوان، قطب علمی تحقیقات گوارش، قطب علمی روماتولوژی، قطب علمی انستیتو تحقیقات بهداشتی، قطب علمی انستیتو سرطان، قطب علمی سم شناسی و مواد خوراکی و قطب علمی شیمی دارویی جایگاه ویژه ای را در پژوهش‌های پزشکی کشور کسب کرده است.

برنامه ریزی استراتژیک دانشگاه، پتانسیل های دانشگاه و مدیریت موثر از طریق به کارگیری راهبردها که شامل پایش و ارزشیابی، بسیج منابع و امکانات، بستر سازی از طریق ترویج و تبلیغ، ایجاد امکان برای بروز خلاقیت‌ها، مشارکت دادن جامعه، استفاده از پژوهش در تصمیم گیری ها، ایجاد شبکه و کارگروهی و تعیین اولویت های پژوهش می‌باشد، از جمله زمینه‌های تحقق این امر عنوان شده است